SN/T 4714-2016 DNA条形码数据库技术规范

SN/T 4714-2016.Technical specification for DNA barcodes database.
1范围
SN/T 4714规定了DNA条形码的分类代码、实体编码、属性数据的结构、数据库构建、运行与维护等技术规范。
SN/T 4714适用于指导检疫性有害生物DNA条形码数据库建设及数据交换。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 2260- -2007 中华 人民共和国行政区划代码
SN/T4621医学媒介生物标本编码规范
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1DNA条形码 DNA barcode
生物体内能够代表该物种的、标准的、有足够变异的、易扩增的DNA特征片段。
3.2候选基因candidate genes
使用DNA条形码进行物种鉴别时供选择的基因。理想的候选基因具有如下特点:种间遗传距离显著大于种内遗传距离,且重叠区小或无。常用的候选基因有线粒体细胞色素C氧化酶1亚基(COI)基因、rDNA ITS序列、质体trnH- psbA 序列、叶绿体rbcL序列等。
3.3聚合酶链式反应polymerase chain reaction PCR
一种分 子生物学技术,用于扩增特定的DNA片段。在该反应中,使用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物,进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性,引物退火和在聚合酶催化下的合成。
3.4测序实验信息sequencing run information
测定DNA条码相关的包含PCR扩增引物、测序引物、实验流程、测序时间、测序机构、测序原始峰图等的信息。文章源自标准下载网-https://www.biao-zhun.cn/38817.html

SN/T 4714-2016 DNA条形码数据库技术规范